नैदानिक संक्रामक रोग पैदा करने में रोगजनक सूक्ष्मजीव एक महत्वपूर्ण कारक हैं। पारंपरिक सूक्ष्मजीवविज्ञानी परीक्षण लंबे समय से ग्राम और पाश्चर जैसे वैज्ञानिकों द्वारा विकसित तरीकों पर निर्भर रहा है। संस्कृति माध्यम की तैयारी, नमूना टीकाकरण, जीवाणु संस्कृति, पहचान और दवा संवेदनशीलता परीक्षण से लेकर, प्रत्येक चरण काफी हद तक मैन्युअल है, जिससे परिणाम की व्याख्या और निर्णय व्यक्तिपरक कारकों के प्रति अतिसंवेदनशील हो जाता है और गुणवत्ता के मामले में इसे नियंत्रित करना मुश्किल हो जाता है।
सूक्ष्मजीवविज्ञानी परीक्षण प्रौद्योगिकी और संबंधित विषयों में प्रगति के साथ, बुद्धिमान परिणाम व्याख्या के साथ स्वचालित सूक्ष्मजीवविज्ञानी परीक्षण उपकरण धीरे-धीरे पारंपरिक तरीकों की जगह ले रहे हैं। ये उपकरण सैकड़ों सामान्य नैदानिक रोगज़नक़ों पर दवा की संवेदनशीलता की तेजी से और सटीक पहचान और विश्लेषण कर सकते हैं।
